21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05470 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  100 
 
 
1279 aa  2601    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  48.45 
 
 
1278 aa  1203    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  33.31 
 
 
1296 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  30.52 
 
 
1125 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  29.92 
 
 
1152 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  31.26 
 
 
1347 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  29 
 
 
1110 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  27.22 
 
 
1123 aa  364  5.0000000000000005e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  28.23 
 
 
1134 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  22.64 
 
 
1267 aa  92.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  27.43 
 
 
884 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  27.3 
 
 
1017 aa  89  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  22.44 
 
 
882 aa  81.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  25.75 
 
 
882 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  27.22 
 
 
865 aa  78.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  26.53 
 
 
1685 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  25.83 
 
 
996 aa  59.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  25.09 
 
 
1086 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  23.92 
 
 
1343 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  27.52 
 
 
468 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  24.09 
 
 
1113 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.139586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>