More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05215 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 
424 aa  858    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.07 
 
 
485 aa  498  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  59.09 
 
 
446 aa  498  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.41 
 
 
492 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  62.37 
 
 
418 aa  488  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.51 
 
 
418 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.82 
 
 
383 aa  484  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.92 
 
 
437 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.32 
 
 
418 aa  479  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.64 
 
 
418 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.37 
 
 
418 aa  474  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.21 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.71 
 
 
497 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.59 
 
 
415 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.15 
 
 
514 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.04 
 
 
506 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.67 
 
 
510 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.42 
 
 
510 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.31 
 
 
499 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.27 
 
 
463 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.16 
 
 
506 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.93 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1595  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.48 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000842121  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  52.5 
 
 
398 aa  413  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.58 
 
 
439 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.63 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  53.51 
 
 
543 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.62 
 
 
426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  52.29 
 
 
454 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.29 
 
 
454 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.15 
 
 
577 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.2 
 
 
535 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.29 
 
 
455 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.29 
 
 
454 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  47.78 
 
 
476 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.29 
 
 
454 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.29 
 
 
454 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  52.29 
 
 
454 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  53.24 
 
 
579 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.51 
 
 
515 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.72 
 
 
452 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.15 
 
 
578 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.75 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.88 
 
 
581 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.83 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.88 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.13 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.75 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.75 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.83 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.16 
 
 
599 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  51.21 
 
 
516 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  52.73 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.91 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.15 
 
 
598 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.75 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.55 
 
 
571 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.02 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.02 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.75 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.49 
 
 
513 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.03 
 
 
485 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0320  hypothetical protein  51.33 
 
 
414 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  51.09 
 
 
506 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  52.14 
 
 
477 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  52.03 
 
 
485 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  52.03 
 
 
485 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  52.03 
 
 
485 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.89 
 
 
482 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  52.42 
 
 
574 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.75 
 
 
462 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.45 
 
 
452 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  48.48 
 
 
477 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.37 
 
 
550 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  52.03 
 
 
485 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  46.95 
 
 
469 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.35 
 
 
526 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.35 
 
 
515 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.15 
 
 
601 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.35 
 
 
525 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.68 
 
 
559 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  51.76 
 
 
484 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  50.91 
 
 
445 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.9 
 
 
533 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  48.69 
 
 
491 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.76 
 
 
479 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  47.73 
 
 
482 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.2 
 
 
491 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.35 
 
 
525 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  52.03 
 
 
486 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.03 
 
 
486 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.3 
 
 
480 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.1 
 
 
549 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.1 
 
 
549 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.17 
 
 
522 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.74 
 
 
477 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.76 
 
 
480 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.03 
 
 
486 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.1 
 
 
578 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.04 
 
 
463 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>