More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04380 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  100 
 
 		 263 aa  534  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  58.33 
 
 		 259 aa  295  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  55.61 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  46.25 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  42.74 
 
 		 282 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  42.34 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  43.62 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  44.03 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  42.15 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  43.95 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  42.98 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  43.21 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  43.21 
 
 		 290 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  43.57 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  41.67 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  44.18 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  43.37 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  41.13 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  42.91 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  42.5 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  41.3 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  43.15 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  43.15 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  43.15 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  41.53 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  43.15 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  44.12 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  41.18 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  40.3 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  40.16 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  47.22 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  44.44 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  41.77 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  42.86 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  44.91 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  43.04 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  41.67 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  40.66 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  44.2 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  41.46 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  41.91 
 
 		 285 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  39.29 
 
 		 272 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  41.91 
 
 		 285 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  41.91 
 
 		 285 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  37.45 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  39.75 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  39.92 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  36.86 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  39.11 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  37.7 
 
 		 288 aa  174  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  40.08 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  36.25 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  38.46 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  41.91 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  33.97 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.04 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0284  glutamate racemase  39.01 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  38.99 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  40.66 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  37.21 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  37.3 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  36.52 
 
 		 333 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  33.19 
 
 		 281 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  36.99 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  35.55 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  41.18 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  32.67 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  35.69 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  31.43 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  35.27 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  35.24 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  32.49 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0174  glutamate racemase  38.25 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000222817  normal  0.0305567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  38.91 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0179  glutamate racemase  38.36 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000377093  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  38.81 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  36.33 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  32.14 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  34.36 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0180  glutamate racemase  37.44 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.815538 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  35.65 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  34.06 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  31.43 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  31.42 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  36.07 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  31.2 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0177  glutamate racemase  35.04 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000496539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  34.38 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0181  glutamate racemase  37.39 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000024601  hitchhiker  0.0092557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  36.78 
 
 		 291 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3509  glutamate racemase  38.81 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00151792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4177  glutamate racemase  37.39 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000486061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  36.67 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3782  glutamate racemase  40.27 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000154676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  35.83 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0133  glutamate racemase  38.18 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00475482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  32.08 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  34.15 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4075  glutamate racemase  34.65 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000696712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  37.27 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>