More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04320 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  65 
 
 
246 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  61.09 
 
 
245 aa  311  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  62.39 
 
 
240 aa  300  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  60 
 
 
260 aa  285  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  54.47 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  55 
 
 
250 aa  280  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
253 aa  277  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  54.51 
 
 
256 aa  272  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  52.56 
 
 
276 aa  271  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
276 aa  269  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.79 
 
 
249 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.25 
 
 
253 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.25 
 
 
253 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.45 
 
 
246 aa  264  8e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
272 aa  262  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.07 
 
 
247 aa  261  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.04 
 
 
249 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
266 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.44 
 
 
249 aa  258  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 
273 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.04 
 
 
249 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
248 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
249 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.5 
 
 
259 aa  255  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  51.28 
 
 
263 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  48.56 
 
 
256 aa  254  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  48.33 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.53 
 
 
249 aa  252  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  51.06 
 
 
260 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
271 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  49.15 
 
 
257 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.5 
 
 
264 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  49.6 
 
 
255 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  48.5 
 
 
252 aa  249  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.01 
 
 
291 aa  249  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
247 aa  249  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
251 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.58 
 
 
241 aa  249  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.33 
 
 
257 aa  248  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
261 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  49.15 
 
 
288 aa  248  6e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
282 aa  248  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
246 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
249 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  48.77 
 
 
274 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
260 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
251 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.08 
 
 
249 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
249 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
260 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.29 
 
 
285 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
260 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
275 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
251 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
275 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
275 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
260 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 
263 aa  245  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
275 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
275 aa  244  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
260 aa  244  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.59 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.01 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.1 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.1 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.1 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.31 
 
 
257 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.82 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
260 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48 
 
 
244 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  49.56 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
260 aa  241  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
252 aa  241  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
252 aa  241  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
260 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
252 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
260 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
260 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>