More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04085 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
151 aa  313  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  68.67 
 
 
151 aa  224  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  69.33 
 
 
151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  62.07 
 
 
147 aa  201  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  60.67 
 
 
151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  62.59 
 
 
147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  61.9 
 
 
150 aa  196  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  60.54 
 
 
149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  57.82 
 
 
147 aa  186  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  54.42 
 
 
147 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  52.32 
 
 
159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  165  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
143 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 
142 aa  164  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  54.23 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 
149 aa  160  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 
142 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  51.06 
 
 
154 aa  159  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 
142 aa  159  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 
163 aa  159  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  50.35 
 
 
142 aa  158  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
144 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  157  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  51.7 
 
 
149 aa  158  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 
142 aa  158  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  157  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 
142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  157  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 
142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 
145 aa  157  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 
142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 
142 aa  158  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  157  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  157  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  48.95 
 
 
144 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  48.95 
 
 
144 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  157  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 
142 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
145 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  157  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 
148 aa  157  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 
154 aa  157  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  156  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 
154 aa  156  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
151 aa  156  9e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 
154 aa  156  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 
142 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  51.03 
 
 
153 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  48.23 
 
 
142 aa  155  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  155  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  49.32 
 
 
149 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
145 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  50.34 
 
 
154 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 
142 aa  154  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 
154 aa  154  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
170 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  53.1 
 
 
153 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 
148 aa  154  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  51.03 
 
 
153 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 
142 aa  154  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  154  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>