More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03665 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  100 
 
 		 455 aa  891    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  41.86 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  39.27 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  39.73 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  38.83 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  39.07 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  36.36 
 
 		 447 aa  279  9e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  36.99 
 
 		 455 aa  256  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  35.89 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  36.51 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  33.48 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  33.94 
 
 		 454 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  33.02 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  34.91 
 
 		 455 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  34.3 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  34.86 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  32.53 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  31.02 
 
 		 493 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 466 aa  216  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  29.2 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 455 aa  209  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.94 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.45 
 
 		 462 aa  200  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  32.49 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  30.07 
 
 		 451 aa  194  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30.57 
 
 		 496 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  31.66 
 
 		 467 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  28.85 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29.44 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.21 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  30.52 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  30.52 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  30.95 
 
 		 464 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  30.18 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.55 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.92 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  29.12 
 
 		 448 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.15 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.12 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  29.3 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.16 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 445 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  29.31 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 461 aa  170  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  26.71 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  28.05 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  28.29 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.23 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  30 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.74 
 
 		 443 aa  163  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  28.84 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.79 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 456 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.96 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.32 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 454 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  26.4 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  28.84 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  28.12 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>