38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03620 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03620  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1193  protein of unknown function DUF540  32.89 
 
 
259 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.436714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  28.31 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  26.63 
 
 
253 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  27.27 
 
 
249 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  24.86 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  22.93 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  23.98 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  24.88 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4936  protein of unknown function DUF540  24.56 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0550253  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  24.04 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  21.18 
 
 
264 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  21.18 
 
 
257 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  21.52 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  23.96 
 
 
251 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1157  protein of unknown function DUF540  22.41 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  22.16 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  23.6 
 
 
228 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  24.87 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  24.44 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  23.94 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  22.29 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  23.42 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  23.42 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  23.42 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  22.78 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  22.78 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  22.78 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  23.42 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  22.15 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0322  hypothetical protein  25.29 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  22.78 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  22.78 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  23.3 
 
 
250 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0194  protein of unknown function DUF540  23.16 
 
 
283 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  20.35 
 
 
272 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  24.26 
 
 
249 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  21.69 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>