129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03415 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03415  FolB  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  58.47 
 
 
119 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  55.08 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  41.82 
 
 
117 aa  94  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  43.81 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  39.13 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  36.67 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  34.78 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  35.9 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  36.13 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  32.5 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  32.5 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  35.14 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  36.13 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2328  dihydroneopterin aldolase  33.98 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.05 
 
 
305 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  37.27 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  36.45 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  39.17 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  34.78 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  33.98 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.04 
 
 
841 aa  63.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  31.67 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  30.51 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  29.13 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  31.15 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
470 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
310 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  27.35 
 
 
276 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6235  dihydroneopterin aldolase  31.73 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.353905  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
125 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  29.13 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.41 
 
 
333 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  29.75 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.25 
 
 
1211 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  30.83 
 
 
525 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.05 
 
 
337 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  27.35 
 
 
121 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  27.35 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3443  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.996393  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  33.63 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.51 
 
 
292 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  31.36 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  26.89 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  26.89 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  32.35 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  26.73 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0928  dihydroneopterin aldolase family protein  25.64 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  32.23 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  28.57 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.09 
 
 
612 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  25.42 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>