More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03350 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  54.87 
 
 		 282 aa  309  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  49.08 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  42.03 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  44.13 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  43.06 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  41.84 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  28.77 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  29.14 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  30.38 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 317 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  29.18 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.31 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.7 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  26.85 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 310 aa  89  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  33.57 
 
 		 672 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  26.97 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  30.52 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  29.38 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.14 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  25.1 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.86 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  32.89 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  29.61 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  32.69 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  37.62 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 1177 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 1177 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  26.17 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  26.28 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 625 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  23.12 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  31.58 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.41 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.15 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  30.66 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.25 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  29.59 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  30.89 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.45 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  29.37 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.17 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  32.29 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 1523 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  19.61 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 		 1037 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0939  Methyltransferase type 12  37 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 1162 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0386  hypothetical protein  27.32 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.669351  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  25.56 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 613 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2221  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 457 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  25.56 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  29.9 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  30.28 
 
 		 407 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.69 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  30 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  29.37 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>