58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03200 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  100 
 
 		 911 aa  1857    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  42.02 
 
 		 919 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  39.08 
 
 		 909 aa  619  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1039 aa  360  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  28.47 
 
 		 968 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  26.66 
 
 		 951 aa  277  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  26.15 
 
 		 969 aa  271  5.9999999999999995e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  26.15 
 
 		 969 aa  271  5.9999999999999995e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  23.89 
 
 		 960 aa  237  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  21.23 
 
 		 1000 aa  177  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  22.22 
 
 		 984 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  20.56 
 
 		 997 aa  152  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1100 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  22.16 
 
 		 794 aa  84.3  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.34 
 
 		 781 aa  76.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  25.08 
 
 		 788 aa  72.8  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  24.09 
 
 		 788 aa  72.4  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  20.24 
 
 		 1001 aa  71.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.89 
 
 		 957 aa  71.6  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1016 aa  70.1  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.13 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  24.44 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  20.38 
 
 		 1049 aa  68.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.04 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  19.84 
 
 		 1048 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  22.01 
 
 		 783 aa  67.8  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.22 
 
 		 1048 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  20.89 
 
 		 1037 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  22.12 
 
 		 999 aa  65.1  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1018 aa  64.3  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.74 
 
 		 858 aa  63.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  24.48 
 
 		 922 aa  63.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  20.83 
 
 		 1054 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  19.55 
 
 		 786 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  22.82 
 
 		 1040 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  20.66 
 
 		 962 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1042 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  20.88 
 
 		 858 aa  57.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  19.68 
 
 		 947 aa  57.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  21.78 
 
 		 991 aa  57.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  20.26 
 
 		 951 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  18.73 
 
 		 993 aa  56.2  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  21.93 
 
 		 988 aa  55.1  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.52 
 
 		 958 aa  54.7  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  18.37 
 
 		 1052 aa  54.7  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  17.54 
 
 		 1014 aa  53.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  19.13 
 
 		 781 aa  52.8  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  19.21 
 
 		 1049 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  20.47 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  21.32 
 
 		 912 aa  49.7  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  21.38 
 
 		 991 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  20.58 
 
 		 1052 aa  49.3  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  17.3 
 
 		 959 aa  48.5  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  20.58 
 
 		 1052 aa  48.5  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.14 
 
 		 1121 aa  48.1  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.87 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.54 
 
 		 994 aa  47.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  29.31 
 
 		 278 aa  46.6  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>