64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02500 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  45.19 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  33.61 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  33.47 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  30.58 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  29.75 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  28.46 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  31.6 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  30.61 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  25.61 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  28.8 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  25.97 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  30.33 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  28.85 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28.86 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  31.9 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  29.31 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  24.84 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  25.81 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  26.61 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.33 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  28.29 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  28.29 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  28.1 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  29.53 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  22.88 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  25.4 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  24 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  22.84 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  29.69 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  26.27 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  28.05 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  22.13 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  29.68 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  27.78 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  24.03 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  23.27 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  23.41 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  23.72 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  30.63 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  28.1 
 
 		 253 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  24.79 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>