More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02185 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 223 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  25.37 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0469  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  28.99 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.09 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  20.44 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  20.44 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  22.55 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
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NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  20.44 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
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NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
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NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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