More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01780 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2052  Patatin  43.72 
 
 		 740 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  48.86 
 
 		 760 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  100 
 
 		 740 aa  1488    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.27 
 
 		 746 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  28.44 
 
 		 720 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.89 
 
 		 751 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.71 
 
 		 728 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  39.02 
 
 		 727 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.18 
 
 		 728 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  39.34 
 
 		 728 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  26.46 
 
 		 852 aa  221  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  26.3 
 
 		 728 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  26.23 
 
 		 933 aa  217  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  26.23 
 
 		 945 aa  217  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  26.49 
 
 		 920 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  26.49 
 
 		 930 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  26.34 
 
 		 714 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  36.2 
 
 		 733 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  29.27 
 
 		 739 aa  211  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  30.67 
 
 		 767 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  25.55 
 
 		 738 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  29.58 
 
 		 738 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  28.91 
 
 		 736 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  30.91 
 
 		 734 aa  207  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.89 
 
 		 735 aa  205  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  30.18 
 
 		 667 aa  205  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.37 
 
 		 738 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  24.79 
 
 		 738 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  23.88 
 
 		 738 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  23.58 
 
 		 738 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  37.11 
 
 		 741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.17 
 
 		 754 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  23.58 
 
 		 737 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  38.18 
 
 		 728 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  26.57 
 
 		 737 aa  197  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  29.25 
 
 		 751 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  28.77 
 
 		 738 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  36.63 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  25.96 
 
 		 748 aa  193  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  26.94 
 
 		 777 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.59 
 
 		 798 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  31.33 
 
 		 796 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  30.61 
 
 		 804 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.34 
 
 		 803 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  30.34 
 
 		 803 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.34 
 
 		 803 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.59 
 
 		 813 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  31.95 
 
 		 737 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  27.09 
 
 		 771 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  30.71 
 
 		 753 aa  185  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  26.07 
 
 		 733 aa  183  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  34.02 
 
 		 735 aa  183  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  32.35 
 
 		 981 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  29.24 
 
 		 750 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  26.08 
 
 		 764 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  26.87 
 
 		 776 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  27.08 
 
 		 790 aa  172  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  28.54 
 
 		 707 aa  170  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  30.75 
 
 		 745 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  35.74 
 
 		 909 aa  165  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  28.96 
 
 		 745 aa  164  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  34.11 
 
 		 900 aa  162  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  31.25 
 
 		 950 aa  161  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  30.03 
 
 		 923 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  31.16 
 
 		 894 aa  157  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  27.32 
 
 		 775 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  32.17 
 
 		 875 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  30.55 
 
 		 260 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  31.18 
 
 		 253 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  28.72 
 
 		 256 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  28.28 
 
 		 272 aa  136  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  29.63 
 
 		 275 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  27.33 
 
 		 333 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.3 
 
 		 275 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  27 
 
 		 320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  27.09 
 
 		 320 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  29.22 
 
 		 310 aa  132  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  31.96 
 
 		 318 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.03 
 
 		 311 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  27.64 
 
 		 310 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  30.74 
 
 		 323 aa  127  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  31.02 
 
 		 599 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  28.73 
 
 		 273 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  28.86 
 
 		 315 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  28.88 
 
 		 259 aa  125  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.58 
 
 		 263 aa  125  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  28.05 
 
 		 316 aa  124  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.62 
 
 		 275 aa  124  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  31.73 
 
 		 250 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  30.35 
 
 		 584 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  28.32 
 
 		 308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28.09 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  27.97 
 
 		 349 aa  122  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  31.51 
 
 		 312 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  28.63 
 
 		 320 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  27.78 
 
 		 311 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  26.54 
 
 		 346 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  26.54 
 
 		 346 aa  121  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.67 
 
 		 306 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  27.93 
 
 		 305 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>