More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01685 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01685  sensor histidine kinase  100 
 
 		 387 aa  781    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2245  histidine kinase  41.64 
 
 		 382 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0052  sensor histidine kinase  40.05 
 
 		 395 aa  292  8e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3618  histidine kinase  38.32 
 
 		 397 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4252  ATP-binding region ATPase domain protein  38.68 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0334  sensor histidine kinase  41.03 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2490  histidine kinase  42.03 
 
 		 427 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.757093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  40.94 
 
 		 446 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  31.53 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  31.71 
 
 		 498 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  32.73 
 
 		 581 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 594 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  29.39 
 
 		 573 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.39 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  30.89 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  30.08 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 753 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  30.49 
 
 		 498 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  30.89 
 
 		 498 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 510 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  31.84 
 
 		 611 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.18 
 
 		 1215 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 779 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  29.27 
 
 		 498 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  29.27 
 
 		 498 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  29.27 
 
 		 498 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 420 aa  96.3  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 738 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  29.88 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  29.19 
 
 		 713 aa  95.9  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  29.88 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 655 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 492 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 655 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.62 
 
 		 714 aa  94  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  30.14 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  30.47 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  32.44 
 
 		 801 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  32.44 
 
 		 801 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  32.44 
 
 		 801 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 655 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  31.56 
 
 		 801 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 518 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  32.02 
 
 		 234 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.84 
 
 		 581 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 488 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 494 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.22 
 
 		 744 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  31.28 
 
 		 490 aa  89.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 898 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.33 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 		 742 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2669  sporulation kinase B  29.15 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 799 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4529  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.8518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2655  sporulation kinase B  29.15 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  hitchhiker  0.000000573688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  26.84 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4895  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 516 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 621 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 551 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.63 
 
 		 584 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.6 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 745 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  32.7 
 
 		 706 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2671  sporulation kinase B  29.52 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0225198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4510  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0814506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.75 
 
 		 752 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 760 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 620 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 515 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 551 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 498 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 708 aa  86.7  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2360  histidine kinase  29 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 480 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  27.46 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.46 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  31.09 
 
 		 567 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4669  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  27.46 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  27.46 
 
 		 608 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  27.46 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5029  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  27.46 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4914  sensor histidine kinase  30.37 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>