More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01565 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 874 aa  1750    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  52.26 
 
 		 924 aa  780    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  41.03 
 
 		 947 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  65.17 
 
 		 887 aa  1170    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  38.78 
 
 		 924 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  38.01 
 
 		 843 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 933 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 987 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 918 aa  466  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  37.78 
 
 		 853 aa  456  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 803 aa  452  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 812 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 812 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 817 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 797 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 812 aa  446  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 797 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 797 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 797 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 948 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 817 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  37.02 
 
 		 870 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 795 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  34.68 
 
 		 797 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 853 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  36.65 
 
 		 850 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  34.67 
 
 		 848 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  36.06 
 
 		 784 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.75 
 
 		 811 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 811 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 847 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 803 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 795 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.02 
 
 		 800 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  33.46 
 
 		 788 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 788 aa  366  1e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 793 aa  361  3e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 800 aa  361  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.36 
 
 		 793 aa  361  4e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  33 
 
 		 795 aa  354  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.66 
 
 		 867 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.33 
 
 		 799 aa  353  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  32.2 
 
 		 884 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  31.33 
 
 		 864 aa  345  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 868 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 871 aa  343  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 883 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 811 aa  333  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.91 
 
 		 856 aa  333  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  31.57 
 
 		 823 aa  332  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 857 aa  331  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 867 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 851 aa  326  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 867 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.38 
 
 		 1015 aa  323  8e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.7 
 
 		 840 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 858 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 869 aa  319  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 847 aa  317  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 861 aa  317  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 804 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 870 aa  313  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.57 
 
 		 821 aa  312  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 835 aa  310  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 800 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 842 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  36.09 
 
 		 948 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 815 aa  303  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 961 aa  300  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 818 aa  295  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 872 aa  295  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.41 
 
 		 832 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 849 aa  263  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 816 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 815 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 833 aa  248  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 842 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 885 aa  238  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 813 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 873 aa  214  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 879 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 877 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 858 aa  202  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 852 aa  195  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 838 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 836 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.5 
 
 		 839 aa  134  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 709 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 843 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 817 aa  125  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 855 aa  124  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 855 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 1030 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1102 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  35.56 
 
 		 1025 aa  106  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  33.6 
 
 		 1095 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1046 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  38.95 
 
 		 849 aa  104  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  41.46 
 
 		 873 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  32.28 
 
 		 1035 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>