54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01455 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  100 
 
 
3089 aa  6077    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  48.1 
 
 
2262 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  46.04 
 
 
1634 aa  451  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  29.84 
 
 
2344 aa  195  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 
2588 aa  144  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  50.36 
 
 
2802 aa  134  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  43.14 
 
 
3227 aa  131  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  30.74 
 
 
2487 aa  130  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  37.44 
 
 
3477 aa  120  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.32 
 
 
3066 aa  116  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  42.51 
 
 
2207 aa  114  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  42.28 
 
 
2192 aa  102  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  41.1 
 
 
2042 aa  102  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  36.07 
 
 
1345 aa  97.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.81 
 
 
2833 aa  96.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  29.14 
 
 
4071 aa  93.2  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  32.46 
 
 
2239 aa  89.7  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.86 
 
 
2402 aa  82  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  32.1 
 
 
1359 aa  80.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  39.81 
 
 
3391 aa  79.7  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.78 
 
 
3089 aa  78.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  41.74 
 
 
2042 aa  78.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  46.74 
 
 
1848 aa  78.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  37.34 
 
 
3699 aa  78.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  36.22 
 
 
3544 aa  77.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  37.34 
 
 
2503 aa  77.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.71 
 
 
3699 aa  74.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 
2831 aa  74.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.14 
 
 
2927 aa  71.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  30.32 
 
 
1170 aa  70.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  28.28 
 
 
2194 aa  70.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  41.44 
 
 
1439 aa  65.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  28.63 
 
 
2715 aa  63.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  26.99 
 
 
1008 aa  60.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  30.35 
 
 
1588 aa  59.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  33.73 
 
 
16311 aa  58.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 
1501 aa  58.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  31.39 
 
 
1585 aa  57.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  29.46 
 
 
1538 aa  57  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  30.97 
 
 
1133 aa  55.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  36.54 
 
 
1526 aa  55.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  35.42 
 
 
2145 aa  54.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 
1061 aa  54.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  33.85 
 
 
1243 aa  53.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.72 
 
 
1217 aa  51.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  31.44 
 
 
887 aa  51.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.25 
 
 
1212 aa  50.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  27.32 
 
 
893 aa  50.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  25.51 
 
 
3562 aa  48.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 
997 aa  49.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  28.79 
 
 
884 aa  48.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  27.98 
 
 
356 aa  48.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  37.39 
 
 
562 aa  48.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  28.28 
 
 
530 aa  46.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>