31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01380 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  100 
 
 
1109 aa  2282    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  37.45 
 
 
984 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  55.92 
 
 
1103 aa  1188    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  35.95 
 
 
1009 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  56.34 
 
 
1093 aa  1271    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  38.67 
 
 
991 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  34.44 
 
 
1076 aa  628  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  35.95 
 
 
993 aa  621  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  34.27 
 
 
989 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  35.98 
 
 
1001 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  33.08 
 
 
1099 aa  572  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  33.2 
 
 
1005 aa  568  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  30.4 
 
 
947 aa  398  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  28.3 
 
 
881 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  38.53 
 
 
882 aa  222  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  38.12 
 
 
881 aa  221  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  29.83 
 
 
875 aa  221  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  35.78 
 
 
880 aa  211  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  37.21 
 
 
880 aa  208  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  31.25 
 
 
880 aa  183  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  29.05 
 
 
621 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  31.1 
 
 
619 aa  84  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  25.51 
 
 
1245 aa  76.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  28.37 
 
 
619 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  24.68 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  26.53 
 
 
624 aa  65.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  24.68 
 
 
623 aa  65.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  27.43 
 
 
619 aa  61.6  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  28.78 
 
 
580 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  28.97 
 
 
634 aa  59.7  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  34.59 
 
 
613 aa  55.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>