More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01220 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  47.1 
 
 		 759 aa  672    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  47.1 
 
 		 759 aa  672    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  53.25 
 
 		 752 aa  782    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  51.93 
 
 		 749 aa  753    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  50.94 
 
 		 759 aa  764    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  51.85 
 
 		 780 aa  776    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.48 
 
 		 755 aa  917    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  47.42 
 
 		 773 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  46.07 
 
 		 759 aa  658    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  50.33 
 
 		 749 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  62.55 
 
 		 754 aa  978    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  45.69 
 
 		 751 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  46.06 
 
 		 764 aa  671    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  47.81 
 
 		 769 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  47.61 
 
 		 759 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  100 
 
 		 766 aa  1567    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  69.74 
 
 		 763 aa  1091    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1940  malic enzyme  47.4 
 
 		 773 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.5551  normal  0.0188499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1033  malic enzyme  47.81 
 
 		 769 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  47.61 
 
 		 759 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  44.78 
 
 		 766 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  50.4 
 
 		 764 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  49.53 
 
 		 751 aa  733    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  47.1 
 
 		 769 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  51.99 
 
 		 752 aa  750    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  45.93 
 
 		 779 aa  674    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3958  malic enzyme  47.53 
 
 		 767 aa  641    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  47.38 
 
 		 758 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  47.13 
 
 		 777 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  50.26 
 
 		 771 aa  728    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  46.27 
 
 		 763 aa  663    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  45.85 
 
 		 759 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  47.52 
 
 		 761 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  56.56 
 
 		 761 aa  901    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  46.73 
 
 		 765 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5338  malic enzyme  47.58 
 
 		 761 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  48.43 
 
 		 783 aa  713    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  47.92 
 
 		 761 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  45.69 
 
 		 759 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  45.24 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  45.89 
 
 		 756 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  47.46 
 
 		 763 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  50.2 
 
 		 749 aa  748    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  52.52 
 
 		 752 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  50.33 
 
 		 758 aa  722    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2118  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  49.13 
 
 		 750 aa  686    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  49.27 
 
 		 751 aa  700    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  47.62 
 
 		 753 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  45.8 
 
 		 759 aa  658    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  45.24 
 
 		 756 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  50.53 
 
 		 771 aa  729    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  47.61 
 
 		 759 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  47.48 
 
 		 759 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  50.73 
 
 		 773 aa  729    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  46.46 
 
 		 758 aa  657    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  46.02 
 
 		 754 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  45.76 
 
 		 769 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  50.53 
 
 		 749 aa  709    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  45.24 
 
 		 754 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  47.47 
 
 		 767 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  47.1 
 
 		 759 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  45.66 
 
 		 760 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2263  malic enzyme  47.4 
 
 		 773 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  45.53 
 
 		 760 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.94 
 
 		 757 aa  937    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  47.62 
 
 		 779 aa  691    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  51.79 
 
 		 752 aa  756    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  45.54 
 
 		 759 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  45.41 
 
 		 777 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  46.5 
 
 		 773 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  47.1 
 
 		 759 aa  671    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  44.97 
 
 		 775 aa  648    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  47.88 
 
 		 764 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  51.32 
 
 		 779 aa  767    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3014  malic enzyme  47.94 
 
 		 751 aa  685    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  45.24 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1754  malic enzyme  49.67 
 
 		 750 aa  697    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.707566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1525  malic enzyme  50.27 
 
 		 750 aa  709    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.875693  normal  0.0504681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  50.53 
 
 		 771 aa  709    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  55.98 
 
 		 757 aa  873    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  47.58 
 
 		 755 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  45.37 
 
 		 756 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  45.19 
 
 		 763 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  46.94 
 
 		 776 aa  673    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  50.07 
 
 		 749 aa  746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  45.68 
 
 		 759 aa  657    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  47.18 
 
 		 761 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  47.1 
 
 		 759 aa  672    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  45.94 
 
 		 761 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  47.23 
 
 		 759 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  47.54 
 
 		 759 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  45.24 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  50.2 
 
 		 758 aa  720    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  47.1 
 
 		 759 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  52.12 
 
 		 757 aa  726    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.01 
 
 		 771 aa  923    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  47.1 
 
 		 759 aa  672    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  45.84 
 
 		 760 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  47.1 
 
 		 759 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  47.61 
 
 		 759 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>