157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01090 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  100 
 
 
681 aa  1407    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  44.48 
 
 
670 aa  599  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  43.5 
 
 
681 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  42.88 
 
 
671 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  40.03 
 
 
700 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  39.3 
 
 
680 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  37.09 
 
 
685 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  38.59 
 
 
690 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  37.76 
 
 
681 aa  480  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  39.53 
 
 
686 aa  475  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  37.02 
 
 
686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  39.18 
 
 
680 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  37.15 
 
 
675 aa  463  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  34.98 
 
 
700 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  34.83 
 
 
696 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  35.92 
 
 
699 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  35.84 
 
 
666 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  35.1 
 
 
693 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  36.08 
 
 
694 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  34.95 
 
 
673 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  34.63 
 
 
711 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  36.8 
 
 
691 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  33.72 
 
 
684 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  36.53 
 
 
746 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  35.81 
 
 
676 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  36.85 
 
 
686 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  36.74 
 
 
750 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  34.89 
 
 
733 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  34.06 
 
 
681 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  35.35 
 
 
669 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  34.92 
 
 
722 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  33.68 
 
 
678 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  33.05 
 
 
712 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  36.5 
 
 
700 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  35.66 
 
 
682 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  35.48 
 
 
673 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  34.06 
 
 
714 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  34.93 
 
 
703 aa  411  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  33.43 
 
 
697 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  34.66 
 
 
721 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  34.02 
 
 
676 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  34.55 
 
 
672 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  32.65 
 
 
679 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  31.76 
 
 
725 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1658  hypothetical protein  37.01 
 
 
607 aa  405  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  34.57 
 
 
720 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  34.22 
 
 
665 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  34.71 
 
 
720 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  34.2 
 
 
669 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  35.32 
 
 
662 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  35.54 
 
 
676 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  33.57 
 
 
737 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  33.38 
 
 
711 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  33.18 
 
 
665 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  36.83 
 
 
641 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  34.54 
 
 
699 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  33.78 
 
 
680 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  31.21 
 
 
756 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  33.58 
 
 
667 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  33.09 
 
 
707 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  31.8 
 
 
744 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  31.37 
 
 
723 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  31.77 
 
 
718 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  33.19 
 
 
665 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  34.15 
 
 
687 aa  382  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  35.11 
 
 
634 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  31.46 
 
 
706 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  35.23 
 
 
706 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  33.53 
 
 
682 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  37.61 
 
 
676 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  32.64 
 
 
717 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  33.28 
 
 
700 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  33.73 
 
 
677 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  33.24 
 
 
673 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  31.59 
 
 
751 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  33.24 
 
 
687 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  31.8 
 
 
660 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  31.6 
 
 
705 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  32.21 
 
 
669 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  32.57 
 
 
699 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  31.08 
 
 
715 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2586  protein of unknown function DUF255  32.39 
 
 
691 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  32.64 
 
 
657 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  32.06 
 
 
718 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  32.24 
 
 
687 aa  364  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  33.15 
 
 
699 aa  363  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  31.92 
 
 
718 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  35.16 
 
 
700 aa  362  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  33.09 
 
 
658 aa  361  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  32.46 
 
 
664 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  32.46 
 
 
664 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  30.57 
 
 
715 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  32.63 
 
 
677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  33.19 
 
 
666 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  32.05 
 
 
652 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  32.55 
 
 
664 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  31.28 
 
 
673 aa  356  8.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  32.41 
 
 
696 aa  355  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  33.72 
 
 
667 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  33.04 
 
 
666 aa  355  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>