174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01050 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
82 aa  160  4e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
85 aa  106  9e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  68.67 
 
 
83 aa  103  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  65.06 
 
 
87 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.77404e-11  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  57.5 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  57.5 
 
 
85 aa  83.2  1e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  56.63 
 
 
88 aa  79.3  2e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  4.52156e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  57.5 
 
 
84 aa  77.4  6e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 
84 aa  77.4  7e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  45.78 
 
 
84 aa  66.6  1e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.67926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  45 
 
 
86 aa  61.2  4e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
86 aa  59.3  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
88 aa  58.2  4e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
88 aa  58.2  4e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 
93 aa  58.2  4e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  56.6  1e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.8734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 
86 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 
86 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  41.46 
 
 
86 aa  55.8  2e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
86 aa  55.5  2e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 
86 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  55.1  3e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.04078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  54.3  5e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  40.7 
 
 
88 aa  53.5  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
87 aa  52.4  2e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 
83 aa  52.8  2e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 
83 aa  52.4  2e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 
83 aa  52.4  2e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
86 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
86 aa  52  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
87 aa  51.2  4e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  41.86 
 
 
92 aa  50.8  6e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  5.36683e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  40 
 
 
86 aa  50.8  6e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
90 aa  50.8  7e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  40.96 
 
 
92 aa  50.4  8e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  40.96 
 
 
92 aa  50.4  8e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  39.29 
 
 
88 aa  49.7  1e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
89 aa  50.1  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 
95 aa  49.7  1e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  49.3  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
89 aa  49.3  2e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  49.3  2e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.25202e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  39.53 
 
 
90 aa  48.5  3e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
87 aa  48.5  3e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  48.1  4e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
87 aa  48.1  4e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  42.86 
 
 
87 aa  48.1  4e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 
89 aa  48.1  4e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
86 aa  47.8  5e-05  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  40.74 
 
 
97 aa  47.8  5e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 
89 aa  47.8  5e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  40 
 
 
87 aa  47  8e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  38.96 
 
 
151 aa  47.4  8e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  38.55 
 
 
86 aa  47  9e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  33.72 
 
 
87 aa  47  9e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  40.48 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  36.25 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  37.35 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  36.05 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31209e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  37.97 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.43906e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  5.03412e-05 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  35.44 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53249e-08 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.71927e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  39.02 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.11095e-08  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.0022e-08  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0478  SSU ribosomal protein S20P  33.72 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.075192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3181  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0928109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.22066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  1.17943e-11 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  36.71 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.91712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7573e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  36.14 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.03326e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>