44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00660 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  63.64 
 
 
264 aa  362  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  60.69 
 
 
263 aa  347  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  42.59 
 
 
278 aa  204  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  41.76 
 
 
275 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  40.15 
 
 
277 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  40.3 
 
 
266 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  41.18 
 
 
274 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  38.18 
 
 
274 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  38.18 
 
 
274 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  42.35 
 
 
266 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  42.13 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  39.71 
 
 
315 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  39.31 
 
 
267 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  39.05 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  41.6 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  38.91 
 
 
279 aa  181  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  38.43 
 
 
276 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  38.43 
 
 
276 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  38.81 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  41.33 
 
 
280 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  38.91 
 
 
286 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  38.72 
 
 
265 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  40.22 
 
 
273 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  40.15 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  40.44 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  40.71 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  38.18 
 
 
284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  39.56 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  40.59 
 
 
273 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  40.59 
 
 
273 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  39.05 
 
 
274 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  40.22 
 
 
273 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  40.22 
 
 
273 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  38.83 
 
 
272 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  37.18 
 
 
275 aa  168  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  38.69 
 
 
274 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  38.32 
 
 
274 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  38.32 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  36.86 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  38.85 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  32.83 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  24.18 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01910  hypothetical protein  25.41 
 
 
297 aa  42  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.35674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>