209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00570 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  45.04 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  39.76 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  32.68 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  32.8 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  29.53 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 		 278 aa  131  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  29.57 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  26.73 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  26.81 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  24.19 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  33.68 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.06 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  28.34 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  30.96 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  23.72 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  27.33 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  23.28 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.66 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  24.76 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  23.2 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 283 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  21.1 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  25.41 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  26.63 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  28.34 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  23.85 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  26.37 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  23.85 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  22.27 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  24.86 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  24.86 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.02 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  26.02 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  22.29 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  28.8 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  26.28 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  22.05 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  23.62 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  24.57 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  23.88 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  23.62 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  26.8 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  29.12 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  25.51 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1403  Rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000400857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  19.15 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  24 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  23.18 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  23.18 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>