More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00475 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  100 
 
 		 109 aa  228  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  55.05 
 
 		 109 aa  133  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  54.05 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  50.46 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  54.05 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  53.15 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  53.64 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  50.46 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  51.38 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  51.38 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  51.38 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  44.94 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  32.38 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  43.42 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  46.97 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.62 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.62 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  30.56 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  31.94 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  32.94 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  35.24 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  29.91 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  41.98 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  29.03 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  33.8 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  30.95 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  35.53 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  31.03 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  37.31 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>