41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00415 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  100 
 
 		 374 aa  776    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  48.51 
 
 		 877 aa  361  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  25.52 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.87 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  22.39 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  21.47 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  23.03 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  26.78 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.13 
 
 		 947 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  20.59 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  29.27 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  25.26 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  21.25 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  25.1 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.97 
 
 		 739 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  41.43 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  28.7 
 
 		 596 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  24.51 
 
 		 495 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  34.07 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.22 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  29.82 
 
 		 146 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.82 
 
 		 849 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  38.98 
 
 		 259 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.27 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  22.93 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  36.62 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  19.16 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.07 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04295  hypothetical protein  28.05 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  19.93 
 
 		 633 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  28.95 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.63 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  21.23 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.31 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.29 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1001 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  41.86 
 
 		 614 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  47.5 
 
 		 964 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.91 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>