46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00410 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  100 
 
 		 412 aa  829    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  39.51 
 
 		 877 aa  250  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  27.81 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  23.86 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  26.79 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.97 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  24.8 
 
 		 474 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  25.17 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  21.65 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  26.21 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  22.76 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.11 
 
 		 476 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  23.11 
 
 		 482 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  20.57 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  20.92 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.27 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  22.22 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  24.94 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  24.94 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  22.49 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  21.67 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  20.88 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  23.96 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.61 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  21.07 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  22.19 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  21.09 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  21.13 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  21.51 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  17.14 
 
 		 472 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  24.65 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  21.54 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  28.37 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.29 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  19.56 
 
 		 947 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  30.82 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  21.32 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  20.74 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  20.75 
 
 		 467 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  21.26 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  26 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  27.56 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.37 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.31 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  19.75 
 
 		 495 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  39.58 
 
 		 920 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>