86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00320 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1189    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  41.84 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  23.38 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  21.18 
 
 		 644 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  21.15 
 
 		 640 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  31.31 
 
 		 673 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  29.36 
 
 		 671 aa  73.6  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  25.85 
 
 		 662 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  22.93 
 
 		 364 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  31.85 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  26.59 
 
 		 738 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  26.53 
 
 		 674 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  27.31 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  29.93 
 
 		 684 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  30.07 
 
 		 796 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  27 
 
 		 679 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  29.89 
 
 		 946 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  31.17 
 
 		 994 aa  60.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  30.16 
 
 		 773 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  30.27 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  33.06 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  26.76 
 
 		 756 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1701  hypothetical protein  22.58 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000152593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2277  hypothetical protein  22.58 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00219668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  30.07 
 
 		 720 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  29.78 
 
 		 633 aa  54.3  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  24.27 
 
 		 771 aa  53.9  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  34.21 
 
 		 667 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  25.21 
 
 		 630 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  28.4 
 
 		 698 aa  53.5  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  28.18 
 
 		 626 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  31.48 
 
 		 722 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  22.22 
 
 		 598 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  27.97 
 
 		 609 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  28 
 
 		 627 aa  51.6  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1317  hypothetical protein  22.35 
 
 		 625 aa  50.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  29.51 
 
 		 987 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2002  heat shock protein 90  27.32 
 
 		 613 aa  50.8  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.240397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  29.84 
 
 		 989 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  28.45 
 
 		 702 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  32.5 
 
 		 860 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  25.26 
 
 		 665 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  25.26 
 
 		 665 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  26.5 
 
 		 634 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  25.45 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  27.64 
 
 		 774 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  27.45 
 
 		 628 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  26.87 
 
 		 628 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  28.02 
 
 		 615 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0109  hypothetical protein  20.25 
 
 		 672 aa  47.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  22.66 
 
 		 774 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  27.22 
 
 		 638 aa  47.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  27.27 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  27.17 
 
 		 623 aa  47  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0940  DNA topoisomerase IV subunit B  26.42 
 
 		 660 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0156854  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  25.81 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  27.59 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  25.64 
 
 		 634 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  23.65 
 
 		 971 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0694  DNA topoisomerase IV subunit B  25.79 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  27.59 
 
 		 629 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  27.07 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1300  DNA topoisomerase IV subunit B  25.79 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  25.79 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1145  DNA topoisomerase IV subunit B  25.79 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0778193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1137  DNA topoisomerase IV subunit B  25.79 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2208  DNA topoisomerase IV subunit B  25.79 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  25.65 
 
 		 656 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  25 
 
 		 613 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2526  DNA topoisomerase IV subunit B  25.79 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  27.78 
 
 		 647 aa  45.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  24.89 
 
 		 635 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  23.21 
 
 		 632 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  27.59 
 
 		 625 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  27.56 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  25.56 
 
 		 637 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3369  heat shock protein 90  25.84 
 
 		 677 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000119649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  25.32 
 
 		 637 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  25.95 
 
 		 637 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  25.32 
 
 		 637 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  25.5 
 
 		 635 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  25.32 
 
 		 637 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  34 
 
 		 719 aa  43.9  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  23.67 
 
 		 650 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3728  HSP90 family molecular chaperone-like protein  27.71 
 
 		 958 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00163945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  25.32 
 
 		 637 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>