266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00245 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00245  site-specific DNA-methyltransferase  100 
 
 
735 aa  1497    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.191981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  41.41 
 
 
435 aa  107  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  32.12 
 
 
518 aa  104  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  47.37 
 
 
434 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  31.39 
 
 
423 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0401  C-5 cytosine-specific DNA methylase  53.19 
 
 
520 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.428624  hitchhiker  0.000124126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  39.1 
 
 
464 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.61 
 
 
357 aa  97.4  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  40.14 
 
 
415 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00287  probable C-5 cytosine-specific DNA methylase  47.32 
 
 
113 aa  94.4  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  37.09 
 
 
437 aa  92  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  42.97 
 
 
418 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  42.97 
 
 
418 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  37.58 
 
 
334 aa  90.9  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  28.91 
 
 
438 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.51 
 
 
431 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
440 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
440 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.33 
 
 
489 aa  89  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  39.6 
 
 
406 aa  88.6  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
331 aa  87.4  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  36.49 
 
 
421 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  35.58 
 
 
474 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.14 
 
 
405 aa  86.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
308 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.51 
 
 
395 aa  84  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  35.92 
 
 
508 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  38.86 
 
 
388 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 
434 aa  84  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 
727 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.11 
 
 
451 aa  82.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  35.33 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  29.07 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  36.81 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
373 aa  80.1  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  29.75 
 
 
671 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  36.91 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  36.81 
 
 
313 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 
434 aa  79  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  33.77 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  35.67 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.87 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.37 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  36.76 
 
 
443 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
423 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  37.59 
 
 
465 aa  77  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  32.65 
 
 
320 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  31.91 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 
462 aa  76.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  34.44 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  34.04 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  36.73 
 
 
657 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  31.01 
 
 
652 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
508 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.13 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  36.84 
 
 
657 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 
698 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
423 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  32.95 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 
686 aa  72.4  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.06 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
437 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  32.91 
 
 
417 aa  72  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  35.1 
 
 
311 aa  72  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
423 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  35.38 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
454 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
325 aa  70.1  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  30.77 
 
 
320 aa  70.5  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  33.78 
 
 
446 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  32.41 
 
 
323 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
406 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  33.11 
 
 
409 aa  70.5  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  34.25 
 
 
350 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 
689 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  31.01 
 
 
358 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  30.22 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  33.55 
 
 
413 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
361 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.25 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  31.97 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  26.97 
 
 
520 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.94 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>