More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00130 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 326 aa  674    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  82.21 
 
 		 453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  72.59 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  68.5 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  67.79 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  55.21 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  55.11 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  53.87 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  53.37 
 
 		 332 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  51.07 
 
 		 455 aa  338  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  50.76 
 
 		 463 aa  336  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  54.24 
 
 		 464 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  49.38 
 
 		 459 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.38 
 
 		 459 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.07 
 
 		 459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.84 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  51.38 
 
 		 456 aa  322  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  51.69 
 
 		 454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  52.45 
 
 		 456 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  48.16 
 
 		 461 aa  318  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  50.76 
 
 		 456 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  52.15 
 
 		 454 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  50.92 
 
 		 455 aa  316  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  49.23 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  51.99 
 
 		 455 aa  309  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  50.76 
 
 		 458 aa  308  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.54 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  52.15 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  47.55 
 
 		 469 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  50.61 
 
 		 463 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  51.53 
 
 		 457 aa  299  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  49.69 
 
 		 456 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  48.05 
 
 		 461 aa  292  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  47.51 
 
 		 468 aa  291  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  50.15 
 
 		 464 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  48.48 
 
 		 462 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  48.05 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  49.54 
 
 		 464 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  49.24 
 
 		 464 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  49.24 
 
 		 464 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  49.24 
 
 		 464 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  41.85 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  49.24 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  42.72 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  48.62 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  48.01 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  41.85 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  43.96 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  42.77 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  44.2 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  45.62 
 
 		 463 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  49.53 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  45.29 
 
 		 468 aa  276  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  47.4 
 
 		 464 aa  275  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.11 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  41.49 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  42.72 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  42.72 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.67 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  40.8 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  45.59 
 
 		 521 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  40.12 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  41.18 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  42.54 
 
 		 340 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.77 
 
 		 343 aa  265  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  39.32 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  41.49 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.12 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  43.61 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  44.14 
 
 		 465 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  39.38 
 
 		 479 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  43.61 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  46.54 
 
 		 494 aa  256  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  41.85 
 
 		 459 aa  255  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  45.2 
 
 		 469 aa  255  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  45.72 
 
 		 465 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  41.74 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.8 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  40 
 
 		 346 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.75 
 
 		 342 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  42.39 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  40 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  38.44 
 
 		 457 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  38.44 
 
 		 457 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.94 
 
 		 465 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  39.69 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  41.64 
 
 		 394 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  40.12 
 
 		 405 aa  249  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  40.31 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.69 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  39.51 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  40.19 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.94 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  40.31 
 
 		 344 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.89 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  39.69 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  39.56 
 
 		 370 aa  238  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 345 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  44.24 
 
 		 535 aa  238  9e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  42.54 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>