More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00040 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  77.97 
 
 		 229 aa  362  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  72.84 
 
 		 232 aa  353  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  76.21 
 
 		 229 aa  341  5.999999999999999e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  71.11 
 
 		 232 aa  328  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  69.78 
 
 		 232 aa  328  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  68.28 
 
 		 232 aa  324  8.000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  60.62 
 
 		 232 aa  295  5e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  59.38 
 
 		 229 aa  278  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1707  50S ribosomal protein L1  61.88 
 
 		 229 aa  275  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  60.27 
 
 		 229 aa  274  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 231 aa  264  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 229 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  59.38 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  54.27 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  56.11 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  55.84 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  52.94 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 231 aa  244  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 231 aa  242  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  52.02 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  52.68 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  53.42 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  51.8 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 230 aa  234  7e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  50.22 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  53.42 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  50 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  51.58 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  50 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  50 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  47.83 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  48.94 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  51.1 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  50 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  46.72 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  49.78 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>