More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1231 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 396 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  54.48 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  54.73 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  53.22 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  53.22 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  53.22 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  53.22 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  53.22 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  52.97 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  53.22 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  52.97 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  54.43 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  54.41 
 
 		 389 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  54.95 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  53.06 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  54.21 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  53.96 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  54.21 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  51.21 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  50.84 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  47.8 
 
 		 391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  46.38 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  46.02 
 
 		 400 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  47.23 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  46.51 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  46.44 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  46.27 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  45.72 
 
 		 389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  45.59 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  45.31 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  45.34 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  43.36 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  41.13 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  43.35 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  43.95 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  44.42 
 
 		 409 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  42.89 
 
 		 390 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  42.39 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  42.39 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  42 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.25 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  40.91 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  42.64 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  43.53 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  43.73 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  43 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  42.79 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  42.79 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  42.79 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  42.79 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  42.79 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  42.79 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  42.79 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  39.9 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.95 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  41.06 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  44.12 
 
 		 394 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  42.54 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  42.05 
 
 		 383 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  42.93 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  42.08 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  43.08 
 
 		 369 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  37.83 
 
 		 408 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  38.83 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  41.99 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  42.4 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  40.53 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  39.38 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  38.9 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  41.67 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  38.9 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.94 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  38.9 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.94 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  38.9 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.94 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  41.71 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  42.57 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  41.52 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  42.33 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  41.47 
 
 		 386 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  40.78 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  38.75 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2511  OmpC family outer membrane porin  42.65 
 
 		 396 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751343  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  39.28 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  39.95 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  39.95 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  39.95 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  39.52 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  41.91 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  38.5 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  39.23 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  39.8 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.26 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  39.15 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.98 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  41.47 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  39.7 
 
 		 375 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  42.33 
 
 		 384 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>