117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1116 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  95.35 
 
 
344 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
344 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.67 
 
 
352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  52.67 
 
 
355 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  51.67 
 
 
322 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  31.37 
 
 
341 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  31.21 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  30.72 
 
 
323 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  32.53 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  29.43 
 
 
317 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  32.53 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  31.42 
 
 
324 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  30.34 
 
 
322 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  32.52 
 
 
324 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  29.66 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  32.13 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  32.13 
 
 
322 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  32.52 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  29.66 
 
 
321 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  31.16 
 
 
332 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  28.96 
 
 
317 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  29.57 
 
 
316 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  27.78 
 
 
337 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  28.91 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  32.65 
 
 
319 aa  135  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  31.53 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.51 
 
 
321 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  30.48 
 
 
332 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  29.76 
 
 
323 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.74 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  28.97 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  28.66 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  29.64 
 
 
323 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.64 
 
 
323 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.64 
 
 
323 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.64 
 
 
323 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.64 
 
 
323 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.64 
 
 
323 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  27.3 
 
 
324 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  31.09 
 
 
320 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.16 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  30.12 
 
 
344 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  27.53 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  30.95 
 
 
321 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  30.56 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.29 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  28.57 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.29 
 
 
323 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  30.03 
 
 
322 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  27.03 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  28.57 
 
 
326 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.15 
 
 
327 aa  125  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  28 
 
 
584 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  30.16 
 
 
321 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  30.16 
 
 
321 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  30.16 
 
 
321 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  27.3 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  24.3 
 
 
320 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  29.17 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  27.87 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.45 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  27.76 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  28.38 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  27.38 
 
 
341 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  26.78 
 
 
331 aa  113  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  27.03 
 
 
340 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  27 
 
 
341 aa  112  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  29.21 
 
 
335 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  27.15 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  29.37 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  29.31 
 
 
331 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.15 
 
 
347 aa  106  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  25.88 
 
 
328 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  28.28 
 
 
333 aa  106  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  28.91 
 
 
270 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  27.31 
 
 
370 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  26.96 
 
 
322 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  27.04 
 
 
349 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  27.07 
 
 
349 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  25.34 
 
 
322 aa  99.4  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  25.17 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  25.74 
 
 
328 aa  99.4  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  25.77 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  25.19 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  24.57 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.79 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  26.28 
 
 
319 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.19 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  24.75 
 
 
640 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  26.84 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  25.17 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25.46 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  26.35 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  21.86 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  23.82 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.54 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  25.32 
 
 
384 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25.18 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  24.85 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  23.93 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>