195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1113 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  85.8 
 
 		 492 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  100 
 
 		 503 aa  1023    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  66.87 
 
 		 474 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30.15 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  20.86 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  31.53 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  31.35 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  21.19 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  27.2 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.75 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  21.33 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  26.94 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  27.52 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  24.81 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  24.86 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  28.43 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  25.15 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  30.05 
 
 		 491 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  29.03 
 
 		 625 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.75 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  28.34 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  21.32 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.53 
 
 		 511 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  24.3 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  24.3 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  42.03 
 
 		 359 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  41.67 
 
 		 644 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  24.8 
 
 		 448 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  50.94 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.92 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  23.81 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  27.92 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  24.04 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  20.72 
 
 		 466 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  28.69 
 
 		 565 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  25.68 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.08 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  21.1 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  26.47 
 
 		 394 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  22.09 
 
 		 511 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  27.49 
 
 		 619 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  29.3 
 
 		 624 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  25 
 
 		 461 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  25.41 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  64.1 
 
 		 496 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  64.1 
 
 		 496 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  20.72 
 
 		 466 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  61.54 
 
 		 616 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  61.54 
 
 		 619 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  35.06 
 
 		 647 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  35.06 
 
 		 647 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  25.2 
 
 		 552 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 361 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  26.32 
 
 		 396 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  40.48 
 
 		 532 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  23.79 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  22.19 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  24.22 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  35.71 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  25.42 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  56.41 
 
 		 592 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  19.21 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  24.82 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  30.46 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  25.38 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  25.12 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  20.8 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  36.36 
 
 		 645 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  42.86 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  23.16 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  24.1 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  24.37 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  38.03 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  32.29 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  42.86 
 
 		 506 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0152  amine oxidase  41.94 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 346 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  23.74 
 
 		 416 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.95 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  23.79 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  22.17 
 
 		 460 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  47.27 
 
 		 505 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  20.49 
 
 		 466 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  24.62 
 
 		 667 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  24.8 
 
 		 421 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  43.14 
 
 		 526 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  20.12 
 
 		 466 aa  47  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  20.12 
 
 		 466 aa  47  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  24.32 
 
 		 449 aa  47  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.41 
 
 		 460 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  47.27 
 
 		 505 aa  47  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  34.52 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.85 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  35.71 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>