More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1089 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1729  putative sugar transferase  78.43 
 
 
459 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00601292  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  100 
 
 
459 aa  930    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  67.61 
 
 
471 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  67.25 
 
 
475 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  64.64 
 
 
461 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  62.91 
 
 
461 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  64.43 
 
 
461 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  63.6 
 
 
471 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  62.09 
 
 
458 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  60.14 
 
 
445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  61.18 
 
 
471 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.57 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  50.54 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  49.67 
 
 
460 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  52.35 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  48.02 
 
 
457 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.24 
 
 
460 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.46 
 
 
460 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.61 
 
 
465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.93 
 
 
477 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1713  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.46 
 
 
465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.24 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  48.24 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  48.24 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3723  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.8 
 
 
457 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0732572  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5546  sugar transferase  47.8 
 
 
477 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2863  sugar transferase  55.85 
 
 
470 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2531  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.68 
 
 
461 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603157  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6264  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.59 
 
 
471 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  45.65 
 
 
461 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  46.29 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4240  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.74 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.322469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  46.29 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  46.29 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  46.29 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  46.29 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  46.29 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  46.29 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  44.71 
 
 
468 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5119  sugar transferase  46.92 
 
 
468 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.226358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.36 
 
 
467 aa  350  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  51.08 
 
 
471 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.12 
 
 
472 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.66 
 
 
459 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4149  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  50.15 
 
 
468 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4217  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  50.15 
 
 
468 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50.15 
 
 
468 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.24 
 
 
471 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.85 
 
 
468 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3640  sugar transferase  51.53 
 
 
462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4114  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  51.53 
 
 
472 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.17 
 
 
460 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0765  putative lipopolysaccharide biosynthesis related protein  39.7 
 
 
450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.436958  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.69 
 
 
464 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  35.87 
 
 
468 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.32 
 
 
464 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.08 
 
 
346 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  38.74 
 
 
467 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.18 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  40.73 
 
 
456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  36.54 
 
 
464 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  36.54 
 
 
464 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.54 
 
 
464 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.54 
 
 
464 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.54 
 
 
464 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.18 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.54 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.18 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.18 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.97 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.32 
 
 
464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1652  hypothetical protein  42.65 
 
 
348 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0307  hypothetical protein  42.65 
 
 
348 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1455  hypothetical protein  42.65 
 
 
348 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  47.58 
 
 
464 aa  279  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  36.48 
 
 
484 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0274  hypothetical protein  42.36 
 
 
359 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.54 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  33.69 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  36.76 
 
 
466 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.73 
 
 
465 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.16 
 
 
464 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.89 
 
 
473 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1480  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.2 
 
 
484 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0810813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.64 
 
 
464 aa  263  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1536  GumD protein  33.98 
 
 
484 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  40.16 
 
 
473 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  36.4 
 
 
464 aa  260  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.51 
 
 
466 aa  260  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.36 
 
 
473 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.8 
 
 
460 aa  259  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.22 
 
 
505 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0310  sugar transferase  34.65 
 
 
454 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.05 
 
 
506 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.84 
 
 
454 aa  254  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.84 
 
 
472 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.28 
 
 
468 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  32.24 
 
 
484 aa  249  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.36 
 
 
496 aa  249  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  32.2 
 
 
469 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>