More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0890 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  82.01 
 
 
416 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  83.82 
 
 
413 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  100 
 
 
414 aa  863    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  82.85 
 
 
413 aa  725    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  65.42 
 
 
428 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  64.39 
 
 
426 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  63.36 
 
 
431 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.59 
 
 
424 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  61.85 
 
 
427 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  63.4 
 
 
423 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  61.28 
 
 
417 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  62.38 
 
 
415 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  61.34 
 
 
439 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  57.69 
 
 
393 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  42.47 
 
 
384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  41.78 
 
 
370 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  40.07 
 
 
321 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  41.78 
 
 
326 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  40.13 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  40.48 
 
 
387 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  38.64 
 
 
361 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  39.8 
 
 
366 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  39.12 
 
 
396 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  39.06 
 
 
398 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.92 
 
 
403 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.97 
 
 
405 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  36.86 
 
 
403 aa  176  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.25 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.68 
 
 
406 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.68 
 
 
406 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  36.84 
 
 
320 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.93 
 
 
440 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  36.66 
 
 
340 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  37.29 
 
 
298 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  33.9 
 
 
439 aa  159  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  37.17 
 
 
299 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  33.89 
 
 
360 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  35.36 
 
 
1065 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  35.36 
 
 
1065 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.36 
 
 
1065 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  34.25 
 
 
1065 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.36 
 
 
1065 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.36 
 
 
1065 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.36 
 
 
1065 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  31.42 
 
 
609 aa  93.2  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.25 
 
 
1065 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  31.76 
 
 
609 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  33 
 
 
1006 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.09 
 
 
607 aa  90.1  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.25 
 
 
1065 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  36.63 
 
 
554 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  35.82 
 
 
1384 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.24 
 
 
613 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.58 
 
 
599 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  30.67 
 
 
599 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.04 
 
 
605 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.36 
 
 
599 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  33.48 
 
 
599 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  36.07 
 
 
1071 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.72 
 
 
613 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  34.36 
 
 
599 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  34.36 
 
 
599 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  34.45 
 
 
1342 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  33.92 
 
 
599 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9283  predicted protein  33.69 
 
 
623 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  33.92 
 
 
599 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  33.92 
 
 
599 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  33.92 
 
 
599 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.68 
 
 
600 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  34.4 
 
 
628 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  33.92 
 
 
599 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  33.92 
 
 
599 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  34.07 
 
 
540 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.98 
 
 
584 aa  84  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  34.98 
 
 
1257 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.63 
 
 
600 aa  83.2  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
599 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  33.04 
 
 
601 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  34.83 
 
 
1370 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.39 
 
 
596 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.48 
 
 
725 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  36.02 
 
 
1074 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  31.15 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  32.6 
 
 
599 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  32.87 
 
 
600 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  32.87 
 
 
600 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  32.87 
 
 
612 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.48 
 
 
725 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  34.83 
 
 
1232 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  32.5 
 
 
615 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  33.19 
 
 
539 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  31.72 
 
 
535 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  32.99 
 
 
612 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.35 
 
 
599 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.6 
 
 
245 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  32.43 
 
 
623 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03990  sulfite reductase (NADPH), putative  32.49 
 
 
1055 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  29.41 
 
 
588 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>