More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0862 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 288 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  42.46 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.08 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  35.79 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  32.98 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 537 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0907  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.794087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 652 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.05 
 
 		 537 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 542 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  34.41 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.05 
 
 		 520 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 603 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0562  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.93 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000395918  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 542 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 603 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.69 
 
 		 603 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  35.59 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 603 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.53 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6136  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 603 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.54 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.54 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4887  inner-membrane translocator  35 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.53 
 
 		 523 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.71 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  32.42 
 
 		 542 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4798  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337539  normal  0.0254161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 628 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 338 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>