More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0851 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 504 aa  1028    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 		 507 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.03 
 
 		 503 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 		 531 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  38.04 
 
 		 513 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.68 
 
 		 529 aa  310  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 520 aa  309  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 509 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  36.47 
 
 		 529 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 526 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 		 525 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 508 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 508 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 501 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 508 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 518 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 520 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 530 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 525 aa  293  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 537 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 537 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 537 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  36.73 
 
 		 529 aa  293  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 		 520 aa  292  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 520 aa  292  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 517 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.41 
 
 		 526 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 511 aa  290  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.07 
 
 		 527 aa  290  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 521 aa  289  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 		 530 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 516 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 534 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 1043 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  36.13 
 
 		 503 aa  286  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.9 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.3 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.3 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.3 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 540 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.14 
 
 		 565 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.56 
 
 		 524 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.05 
 
 		 526 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 		 503 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.67 
 
 		 533 aa  280  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 515 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 506 aa  279  9e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 527 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 548 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 515 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.47 
 
 		 496 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  34.56 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  35.73 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.47 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.37 
 
 		 519 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  35.39 
 
 		 516 aa  274  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 521 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 509 aa  273  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.27 
 
 		 496 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.27 
 
 		 496 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  35.54 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  38.4 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  34.67 
 
 		 517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 552 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 556 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 502 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 502 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  34.93 
 
 		 552 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 521 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 509 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.05 
 
 		 492 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 512 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 545 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 544 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 502 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 502 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.12 
 
 		 570 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  32.05 
 
 		 549 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 522 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 502 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 541 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>