More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0781 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 391 aa  792    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  63.24 
 
 		 394 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  65.31 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  64.78 
 
 		 389 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  58.2 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  58.92 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  57.84 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  56.6 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  58.95 
 
 		 389 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  46.39 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 377 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  45.08 
 
 		 394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  48.94 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  48.94 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  46.72 
 
 		 376 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  48.39 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  48.27 
 
 		 382 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  43.34 
 
 		 394 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  45.19 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  44.65 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  45.19 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  43.67 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  43.98 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  36.76 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  35.62 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 390 aa  179  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 983 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 984 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.93 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  29.43 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  29.43 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  29.43 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  29.43 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 500 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  29.97 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  25.25 
 
 		 442 aa  123  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 492 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 960 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.32 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 816 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.32 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  25.94 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.46 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.46 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  29.35 
 
 		 822 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.91 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.92 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  26.5 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>