121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0738 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  63.56 
 
 		 250 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  64.41 
 
 		 245 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  60.59 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  60.59 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  63.98 
 
 		 245 aa  284  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  61.7 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  63.56 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  60.59 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  48.1 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  47.08 
 
 		 279 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  44.84 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  45.34 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.98 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.58 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.18 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  34.32 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.5 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.73 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.19 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  33.47 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.2 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.95 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  30.38 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.96 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  35.39 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.05 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  33.47 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  34.44 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.02 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  33.47 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  33.61 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  33.61 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.02 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  33.05 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  33.05 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  33.05 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  33.05 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  33.05 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  33.05 
 
 		 318 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.33 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.64 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  31.78 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  30.93 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  31.36 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  32.22 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.77 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.93 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.77 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  33.74 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  33.74 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  34.38 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  33.05 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.14 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  34.31 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  30.25 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.77 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  30.47 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  31.91 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  34.17 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3252  hypothetical protein  37.36 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  31.58 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  29.71 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  33.62 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  33.62 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  32.54 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.62 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.58 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.25 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  33.95 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  27.97 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.06 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  30.74 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  36.45 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.86 
 
 		 241 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  33.18 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  28.26 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  30.43 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  33.49 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  32.03 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  29.08 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  30.77 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  36.55 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  29.95 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5137  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.38 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  31.98 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  29.38 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.63 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  26.05 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  29.94 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  33.12 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2468  Asp/Glu racemase  32.86 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  28.86 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  31.63 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  33.7 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.79 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>