More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0707 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 536 aa  1078    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 		 523 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 		 523 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 		 523 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 526 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  41.05 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 551 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 555 aa  297  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 584 aa  286  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 553 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 587 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 583 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 591 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 582 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 570 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  30.07 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 570 aa  230  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 574 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.23 
 
 		 644 aa  226  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 518 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 590 aa  220  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 511 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 640 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 578 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 602 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  30.22 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 571 aa  211  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 569 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 525 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  30.34 
 
 		 552 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 508 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.44 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 525 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 843 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 565 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  30.11 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 554 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 511 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  32.41 
 
 		 557 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  32.22 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  29.71 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 517 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  30.18 
 
 		 549 aa  200  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  30.17 
 
 		 570 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 496 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  29.6 
 
 		 517 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 528 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  32.12 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  32.71 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 		 549 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.25 
 
 		 529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.54 
 
 		 550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  29.1 
 
 		 549 aa  198  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 527 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  31.84 
 
 		 557 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29.76 
 
 		 576 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  29.85 
 
 		 570 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  29.85 
 
 		 574 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 515 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 		 546 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 508 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  30.4 
 
 		 570 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  29.6 
 
 		 552 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 506 aa  196  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  30.12 
 
 		 578 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 544 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  29.03 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 501 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  28.33 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  29.72 
 
 		 570 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  32.49 
 
 		 587 aa  195  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  29.33 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  29.72 
 
 		 570 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  29.72 
 
 		 570 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  31.14 
 
 		 522 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 499 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 512 aa  194  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 520 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  29.59 
 
 		 605 aa  193  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 518 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 521 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 505 aa  193  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 520 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  29.44 
 
 		 575 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>