More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0693 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  30.89 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  32.62 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  36.11 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  30.65 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  35.8 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  35.23 
 
 		 259 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  35.59 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 273 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  32.02 
 
 		 320 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  32.45 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  28.82 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.89 
 
 		 241 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 338 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  33.15 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.27 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  32.6 
 
 		 285 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 285 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 278 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 285 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  30.39 
 
 		 282 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  33.53 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.52 
 
 		 245 aa  91.3  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 281 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.15 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.52 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.12 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 270 aa  89  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.69 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  29.35 
 
 		 261 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  31.19 
 
 		 272 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  32.12 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.87 
 
 		 258 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  30.94 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.69 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 		 285 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  37.65 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.82 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  30.94 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  32.2 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  33.53 
 
 		 244 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.71 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  31.11 
 
 		 279 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  35.33 
 
 		 271 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  31.11 
 
 		 279 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  33.53 
 
 		 244 aa  84.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  28.72 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  32.78 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.28 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  32.12 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  32.45 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  37.04 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  30.39 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  30.94 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  38.82 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  34.29 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  29.83 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  28.72 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.46 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.46 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.46 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.46 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.46 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  33.7 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  31.87 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  29.83 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  29.83 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  30.94 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  28.32 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  28.32 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  28.32 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  28.32 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  28.18 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  32.8 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  28.18 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  28.32 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>