14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0688 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0688  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1113  hypothetical protein  47.96 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.341492  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1083  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3361  regulatory protein, MarR  48.75 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41590  hypothetical protein  50.68 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52410  hypothetical protein  52.05 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3127  hypothetical protein  47.3 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338224  decreased coverage  0.00835036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2353  hypothetical protein  33.7 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  30.51 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  29.06 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  31.33 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2270  hypothetical protein  31.18 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2035  hypothetical protein  31.18 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2372  hypothetical protein  31.18 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>