More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0667 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 
389 aa  779    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  54.29 
 
 
436 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  54.57 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  54.57 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  54.57 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  54.04 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  54.57 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  54.57 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  57.14 
 
 
385 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  57.14 
 
 
385 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  54.31 
 
 
386 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  56.56 
 
 
389 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  57.07 
 
 
389 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  56.8 
 
 
389 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  56.77 
 
 
383 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  56.51 
 
 
383 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  56.51 
 
 
383 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  56.25 
 
 
383 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  52.49 
 
 
400 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  57.62 
 
 
402 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  53.08 
 
 
395 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  51.43 
 
 
391 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  51.93 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  51.41 
 
 
400 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  53.21 
 
 
403 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  50.63 
 
 
393 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  46.38 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  45.63 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  46.19 
 
 
409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  47.3 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  52.31 
 
 
352 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  45.52 
 
 
409 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  43.49 
 
 
422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  45.78 
 
 
388 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  47.1 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  45.28 
 
 
378 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  45.33 
 
 
386 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  45.29 
 
 
386 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  42.46 
 
 
389 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  46.61 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  46.61 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  46.61 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  46.61 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  46.61 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  46.61 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  46.61 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  43.29 
 
 
383 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  42.71 
 
 
389 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  46.09 
 
 
414 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  43.25 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  42.49 
 
 
379 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  44.5 
 
 
390 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  41.16 
 
 
380 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.43 
 
 
383 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  41.69 
 
 
391 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.28 
 
 
397 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.62 
 
 
384 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.04 
 
 
394 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  43.28 
 
 
421 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  43.28 
 
 
421 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  44.3 
 
 
383 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  45.36 
 
 
384 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  44.56 
 
 
383 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  44.64 
 
 
410 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.78 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.78 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.78 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.78 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  41.12 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  42.61 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.79 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  43.03 
 
 
397 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  41.3 
 
 
399 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  40.41 
 
 
383 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  45.33 
 
 
379 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45.74 
 
 
374 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  43.18 
 
 
381 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  42.79 
 
 
397 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  41.46 
 
 
394 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  44.56 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  42.17 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  43.26 
 
 
445 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  43.12 
 
 
385 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  43.07 
 
 
386 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.09 
 
 
384 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.09 
 
 
384 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  44.47 
 
 
384 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.09 
 
 
384 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  44.94 
 
 
381 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  41.13 
 
 
397 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  43.61 
 
 
386 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  42.68 
 
 
387 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  43.88 
 
 
386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  43.36 
 
 
386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  42.33 
 
 
385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  42.82 
 
 
386 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  41.92 
 
 
379 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  43.36 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  43.36 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>