More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0511 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  100 
 
 
389 aa  806    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  62.73 
 
 
386 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  64.8 
 
 
391 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  65.18 
 
 
390 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  61.13 
 
 
392 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  63.61 
 
 
390 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  62.08 
 
 
394 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  61.34 
 
 
395 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  63.09 
 
 
390 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  63.28 
 
 
390 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  65.88 
 
 
385 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  64.57 
 
 
385 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  62.63 
 
 
389 aa  461  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  63.52 
 
 
385 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  63.52 
 
 
385 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  62.99 
 
 
385 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  61.36 
 
 
389 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  53 
 
 
388 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  45.03 
 
 
385 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  43.34 
 
 
381 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  39.69 
 
 
389 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  44.19 
 
 
387 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.73 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.88 
 
 
397 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.76 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  37.31 
 
 
394 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.98 
 
 
387 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  35.97 
 
 
396 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  35.58 
 
 
383 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.67 
 
 
378 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  35.19 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.99 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.1 
 
 
388 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.04 
 
 
389 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  36.53 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.2 
 
 
360 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  33.59 
 
 
385 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  34.07 
 
 
405 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  37.47 
 
 
453 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.74 
 
 
396 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.31 
 
 
393 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.29 
 
 
550 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  33 
 
 
397 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.33 
 
 
388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.33 
 
 
388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.33 
 
 
388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.23 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.04 
 
 
550 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.88 
 
 
388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.04 
 
 
550 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.88 
 
 
388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.88 
 
 
388 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.88 
 
 
388 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  33.79 
 
 
395 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.6 
 
 
388 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  35.11 
 
 
390 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.38 
 
 
548 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  34.77 
 
 
383 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.11 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.68 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  33.33 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.42 
 
 
541 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  35.9 
 
 
548 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  33.5 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.88 
 
 
388 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  35.32 
 
 
384 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.11 
 
 
389 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  36.99 
 
 
381 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  33.77 
 
 
389 aa  176  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  34.17 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.67 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  33.25 
 
 
388 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  32.34 
 
 
383 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  33.25 
 
 
379 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  33.42 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.89 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  34.17 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.38 
 
 
385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.71 
 
 
379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  33.06 
 
 
379 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.2 
 
 
390 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.05 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.42 
 
 
390 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  30.15 
 
 
400 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.89 
 
 
383 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.24 
 
 
383 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  31.05 
 
 
391 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  33.15 
 
 
402 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.7 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  32.88 
 
 
402 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  34 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.59 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  31.54 
 
 
393 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  32.51 
 
 
393 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  30.45 
 
 
390 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 
382 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  31.66 
 
 
390 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  34.47 
 
 
382 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>