More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0497 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 393 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  50 
 
 		 391 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  48.49 
 
 		 436 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  48.49 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  48.49 
 
 		 386 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  48.49 
 
 		 386 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  48.49 
 
 		 386 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  48.49 
 
 		 386 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  48.49 
 
 		 386 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  48.24 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  47.81 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.87 
 
 		 385 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  48.61 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  47.94 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.37 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  46.06 
 
 		 409 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.36 
 
 		 383 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  45.04 
 
 		 408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  45.79 
 
 		 400 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  45.48 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.59 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.6 
 
 		 383 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.6 
 
 		 383 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  46.91 
 
 		 398 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  46.97 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  45 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  45.73 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  45.43 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  43.26 
 
 		 422 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  45.19 
 
 		 400 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.19 
 
 		 389 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.68 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  44.61 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  42.36 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  45.35 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  42.27 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  43.19 
 
 		 403 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  41.24 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  42.37 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  44.14 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  42.12 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  45.86 
 
 		 410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  42.44 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  42.75 
 
 		 412 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  41.27 
 
 		 386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  42.39 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  40.2 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  42.93 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  40.95 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  40.95 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  40.16 
 
 		 388 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  42.64 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  39.95 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  39.9 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  41.1 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  40.67 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  41.4 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  38.27 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  40.16 
 
 		 385 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  38.9 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  42.56 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  41.09 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  38.48 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  40.59 
 
 		 430 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  40.59 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  39.24 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  40.59 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  40.85 
 
 		 390 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  38.16 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  40.35 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  40.84 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  38.16 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  40.84 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  40.35 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  38.16 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  38.16 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  40.35 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  40.4 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  38.04 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  41.79 
 
 		 390 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  41.79 
 
 		 390 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  40.2 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  37.92 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  39.33 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  40.74 
 
 		 386 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  41.9 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  36.57 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  39.95 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  37.56 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  37.91 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  42.04 
 
 		 523 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  40.67 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.39 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  40.65 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  39.47 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  39.47 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>