147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0455 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  100 
 
 		 402 aa  805    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  79.9 
 
 		 400 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  65.71 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  64.2 
 
 		 410 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  65.39 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  55.53 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  55.53 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  55.64 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  50 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  45.58 
 
 		 380 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  41.7 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  45.79 
 
 		 386 aa  193  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  35.76 
 
 		 391 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  45.71 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  44.7 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  44.7 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  44.39 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  40.98 
 
 		 445 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  39.24 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  42.56 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  41.84 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  32.95 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  39.72 
 
 		 373 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  39.51 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  37.21 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  40.74 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  38.28 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  37.79 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  38.86 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  36.46 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  34.26 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  35.07 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  27.84 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  27.18 
 
 		 369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  32.64 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  37.24 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  31.68 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  31.5 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  35.08 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  36.44 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  34.31 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  32.81 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  33.82 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  32.99 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  31.4 
 
 		 444 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  35.14 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  31 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  30.15 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  31.89 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  32.79 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  25.27 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  34.07 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  30.27 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  30.94 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  33.52 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  32.07 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  30.39 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  30.39 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  31.67 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  30.81 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5547  conjugation TrbI family protein  31.5 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167146 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  34.07 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  31.87 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  32.97 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0020  conjugation TrbI-like protein  31.17 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  29.21 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  32.98 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  28.99 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  28.99 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  32.82 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  29.17 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  29.51 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  32.97 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  31.32 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6569  conjugation TrbI family protein  32.02 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  34.64 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  29.88 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  28.73 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  31.32 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  31.87 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  34.55 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  34.07 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  31.87 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  32.52 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  30.48 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  28.18 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  31.32 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  31.32 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  30.05 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  30.56 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  32.62 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  29.31 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  29.41 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  32.43 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  31.77 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>