45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0453 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  87.25 
 
 		 252 aa  440  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  77.25 
 
 		 234 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  73.89 
 
 		 234 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  73.89 
 
 		 234 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  73.89 
 
 		 234 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  75.91 
 
 		 234 aa  338  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  76.39 
 
 		 239 aa  331  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  39.47 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  35.19 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  38.25 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  33.18 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  33.18 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  33.82 
 
 		 202 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  31.67 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  30.8 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  30.87 
 
 		 351 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  28.37 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  28.94 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  32.37 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  29.56 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  26.07 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  25.93 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  28.91 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  29.72 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  26.84 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  28.36 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  24.76 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  28.44 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  29.52 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  27.6 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  28.22 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  27.72 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  27.81 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  26.6 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  29.31 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  27.54 
 
 		 223 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  23.53 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  25.58 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  27.23 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  25.94 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  25.97 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  26.76 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  28.3 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  25.63 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>