More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0427 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  91.7 
 
 		 278 aa  520  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  79.17 
 
 		 264 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  51.03 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  51 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  51 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  49.8 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  48.46 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  48.59 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  48.59 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  48.59 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  38.75 
 
 		 261 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  38.49 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  35.71 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 254 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  35.69 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  38.84 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  34.78 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  32.38 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  36.72 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.57 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.66 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.5 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  28.27 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  31.47 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.49 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  27.47 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  30.29 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.43 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.39 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.21 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  32.97 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  29.58 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  29.22 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.61 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  27.08 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  28.81 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  32.6 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  32.26 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  31.28 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  32.75 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  31.17 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.4 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  28.21 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.54 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  25.3 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.56 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  36.11 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  29.15 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 218 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  32.88 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.66 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>