29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0400 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0400  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0138  hypothetical protein  72.81 
 
 		 114 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.096273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1180  hypothetical protein  71.93 
 
 		 198 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2447  hypothetical protein  71.93 
 
 		 201 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.950659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1254  hypothetical protein  71.93 
 
 		 114 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6200  hypothetical protein  73.68 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.484468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7085  hypothetical protein  70.18 
 
 		 114 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1236  hypothetical protein  71.93 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6596  hypothetical protein  71.93 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1850  hypothetical protein  57.89 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7213  hypothetical protein  57.02 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2769  hypothetical protein  54.39 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4837  hypothetical protein  52.63 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1069  hypothetical protein  44.74 
 
 		 115 aa  95.9  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1359  hypothetical protein  44.74 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.147484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1695  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4220  hypothetical protein  34.82 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0060  hypothetical protein  35.45 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4252  hypothetical protein  34.23 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122458  decreased coverage  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4776  hypothetical protein  35.14 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3586  hypothetical protein  30.91 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284376  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2606  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2007  hypothetical protein  43.59 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.17329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0773  hypothetical protein  43.59 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1177  hypothetical protein  28.18 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.174378  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3007  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3060  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3095  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>