60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0326 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1465  hypothetical protein  48.65 
 
 
149 aa  148  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.726298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  34.59 
 
 
143 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  31.34 
 
 
142 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  31.13 
 
 
152 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  30.23 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  34.01 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  31.51 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  35.34 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  30.53 
 
 
143 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  30.23 
 
 
140 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  30.23 
 
 
140 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  32.56 
 
 
135 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  32.56 
 
 
135 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  26.24 
 
 
147 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  29.86 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  32.56 
 
 
135 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  29.37 
 
 
141 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  29.37 
 
 
141 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  29.37 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  28.78 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  33.07 
 
 
133 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  29.79 
 
 
146 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  28.12 
 
 
144 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  29.68 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  28.47 
 
 
146 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.66 
 
 
139 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.66 
 
 
150 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  27.08 
 
 
141 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  40.74 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  30.82 
 
 
155 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  30.82 
 
 
155 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  30.82 
 
 
155 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  29.55 
 
 
185 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  30.58 
 
 
130 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  29.5 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  26.87 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  25.19 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  32.77 
 
 
451 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  23.57 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  27.34 
 
 
145 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  28.17 
 
 
174 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  29.5 
 
 
450 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  28.89 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  24.82 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  28.46 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  28.06 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  29.46 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1359  hypothetical protein  29.5 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  25.85 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  28 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  26.12 
 
 
209 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  27.86 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  27.46 
 
 
171 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  23.81 
 
 
158 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.23 
 
 
274 aa  41.2  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  26.06 
 
 
163 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>