213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0253 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
365 aa  743  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  66.19 
 
 
371 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  66.37 
 
 
363 aa  452  1e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  62.97 
 
 
357 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  61 
 
 
365 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  59.26 
 
 
400 aa  416  1e-115  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  56.69 
 
 
349 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  48.7 
 
 
352 aa  351  9e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  48.98 
 
 
374 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  46.04 
 
 
342 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  43.34 
 
 
357 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  45.85 
 
 
359 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  45.56 
 
 
359 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  45.56 
 
 
359 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  45.56 
 
 
359 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  45.56 
 
 
359 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  45.56 
 
 
383 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.06 
 
 
357 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  44.41 
 
 
356 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 
361 aa  259  5e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  43.07 
 
 
344 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  45.56 
 
 
359 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  44.76 
 
 
384 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  43.07 
 
 
344 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  40 
 
 
354 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  42 
 
 
359 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  42.86 
 
 
359 aa  255  1e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  44.19 
 
 
358 aa  254  2e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  41.47 
 
 
349 aa  254  2e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  41.71 
 
 
359 aa  254  2e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  40.36 
 
 
343 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 
359 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  44.41 
 
 
359 aa  251  9e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  39 
 
 
354 aa  252  9e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  44.41 
 
 
359 aa  251  9e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  39.71 
 
 
341 aa  252  9e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  40.87 
 
 
349 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  37.85 
 
 
354 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  44.13 
 
 
359 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  41.71 
 
 
358 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  43.84 
 
 
359 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  42.49 
 
 
363 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.48581e-06 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  37.98 
 
 
354 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  45.23 
 
 
331 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  41.31 
 
 
357 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  39.94 
 
 
329 aa  240  3e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  41.52 
 
 
344 aa  240  3e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  44.41 
 
 
326 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  40.35 
 
 
344 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  40.41 
 
 
359 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  41 
 
 
362 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  37.5 
 
 
348 aa  235  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  37.08 
 
 
394 aa  234  1e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  39.88 
 
 
340 aa  232  8e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  36.21 
 
 
352 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  39.07 
 
 
366 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 
369 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  37.17 
 
 
354 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  36.42 
 
 
335 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  30.97 
 
 
353 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
355 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
329 aa  121  1e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
321 aa  121  2e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
324 aa  117  2e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
324 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
321 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  29.97 
 
 
335 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 
332 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6747  hypothetical protein  48.33 
 
 
214 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405186  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.71524e-08  normal  0.300872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
368 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  23.12 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97877e-05 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  24.84 
 
 
323 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  26.83 
 
 
331 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.24 
 
 
346 aa  85.9  1e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25.84 
 
 
328 aa  85.1  2e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
332 aa  85.1  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
325 aa  85.1  2e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 
323 aa  83.6  5e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  29.03 
 
 
363 aa  81.3  2e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 
322 aa  81.6  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
320 aa  80.1  5e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
331 aa  79.7  7e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
346 aa  77.8  2e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
354 aa  77  5e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
314 aa  76.3  8e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
324 aa  74.7  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 
337 aa  73.9  4e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
351 aa  73.6  5e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
328 aa  72  2e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.51 
 
 
348 aa  71.6  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
334 aa  71.2  3e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 
862 aa  70.1  5e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.23 
 
 
334 aa  68.2  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 
323 aa  67  5e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>